Nie złożył VAT-R, musi zapłacić podatek

Przedsiębiorca, który zawiesił działalność gospodarczą będąc czynnym podatnikiem VAT, po jej wznowieniu nadal ma taki status - wynika z indywidualnej interpretacji.

Podatnik w lipcu 2021 r. rozpoczął prowadzenie działalności gospodarczej, w ramach której zajmował się sprzedażą owoców i warzyw w sklepie stacjonarnym. Podatek dochodowy rozliczał w formie ryczałtu od przychodów ewidencjonowanych. Tę działalność zawiesił we wrześniu 2022 r. Przez prawie cały okres jej prowadzenia był zwolniony z VAT, zaś czynnym podatnikiem VAT był wyłącznie przez okres ostatnich dwóch tygodni przed zawieszeniem działalności.

W listopadzie 2025 r. podatnik wznowił prowadzenie działalności, jednak już o innym profilu (sprzedaż zabawek przez Internet). W związku z tym mężczyzna zawarł umowę o prowadzenie obsługi księgowej z biurem rachunkowym. Przez to biuro został poinformowany, że po wznowieniu działalności przysługuje mu zwolnienie podmiotowe z VAT do limitu 200 000 zł (taki limit obowiązywał w roku 2025) i że nie musi podejmować dodatkowych czynności rejestracyjnych w zakresie VAT. Jednak w grudniu 2025 r. dowiedział się w Urzędzie Skarbowym, że nie jest objęty zwolnieniem, a jego firma ma status czynnego podatnika VAT. To oznacza, że od momentu wznowienia działalności podatnik prowadził ją w oparciu o błędne informacje uzyskane w biurze księgowym. W konsekwencji:

• nie doliczał podatku VAT do cen sprzedaży i nie miał możliwości przerzucenia go na kontrahentów,
• został postawiony przed koniecznością nagłej zapłaty podatku, co w praktyce pochłonęło cały osiągnięty dochód,
• był zmuszony wstrzymać sprzedaż, aby nie ponosić kolejnych strat.

W połowie grudnia 2025 r. mężczyzna zapłacił podatek VAT (mimo przekonania, że nie powinien go płacić), złożył do Urzędu Skarbowego czynny żal, wniosek o przywrócenie terminu na złożenie zgłoszenia aktualizacyjnego VAT-R, wystąpił też o indywidualną interpretację w tej sprawie. Poprosił w nim o potwierdzenie jego statusu podatkowego w okresie listopad-grudzień 2025 r. wskazując, że w jego przypadku kluczowe znaczenie powinna mieć jego wola korzystania ze zwolnienia podmiotowego oraz spełnienie warunku limitu sprzedaży, a nie sam fakt formalnego braku zgłoszenia aktualizacyjnego. Argumentował, że skoro działał w dobrej wierze, opierając się na informacjach uzyskanych od profesjonalnego biura rachunkowego, to niezłożenie VAT-R nie powinno skutkować automatycznym uznaniem go za czynnego podatnika VAT.

Dodatkowo, ponieważ wartość sprzedaży w 2025 r. nie przekroczyła 200 tys. zł, mężczyzna złożył wniosek o zwolnienie z VAT na 2026 r. i został zarejestrowany jako podatnik VAT zwolniony.

Z firmly przygotujesz i wyślesz JPK_V7M lub JPK_V7K prosto z przeglądarki!
firmly ułatwia wprowadzanie faktur, generowanie JPK_V7M, JPK_V7K i JPK_FA, oraz umożliwia online wysyłkę do urzędu skarbowego z e-podpisem. Sprawdź statusy wysyłki i pobieraj Urzędowe Poświadczenia Odbioru (UPO) bezpośrednio w aplikacji.
Przejdź do firmly i ułatw sobie pracę z JPK »

Przedsiębiorca mimo zawieszenia działalności pozostaje podatnikiem VAT

Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej nie zgodził się ze stanowiskiem przedstawionym przez podatnika. W interpretacji powołał się na treść art. 113 ustawy o podatku od towarów i usług, w którym zawarte są regulacje dotyczące możliwości skorzystania zwolnienia podmiotowego z VAT przez wybranych podatników. I tak z podatku zwalnia się sprzedaż dokonywaną przez podatnika, u którego wartość sprzedaży (z wyłączeniem podatku) nie przekroczyła w poprzednim ani bieżącym roku podatkowym kwoty 240 000 zł – chyba że podatnik:

• zrezygnuje ze stosowania tego zwolnienia,
• dokonuje dostaw bądź świadczy usługi wskazane w art. 113 ust. 13 ustawy, które wyłączają możliwość stosowania zwolnienia.

Z podatku zwolniona jest też sprzedaż dokonywana przez podatnika rozpoczynającego wykonywanie czynności opodatkowanych w trakcie roku podatkowego, jeżeli przewidywana przez niego wartość sprzedaży nie przekroczy, w proporcji do okresu prowadzonej działalności gospodarczej w roku podatkowym, kwoty powyższego limitu – z identycznymi wyłączeniami. Z kolei podatnik, który utracił prawo do zwolnienia sprzedaży od podatku lub zrezygnował z tego zwolnienia, może ponownie z niego skorzystać nie wcześniej niż po upływie roku, licząc od końca roku, w którym utracił prawo do zwolnienia lub zrezygnował z tego zwolnienia.

Dyrektor KIS podkreślił następnie, że zawieszenie działalności gospodarczej samo w sobie nie stanowi zaprzestania wykonywania działalności gospodarczej przez podatnika. Podatnik, który zawiesza prowadzenie działalności gospodarczej na pewien czas, nadal pozostaje podatnikiem podatku od towarów i usług, z tym że w okresie zawieszenia wykonywania działalności przedsiębiorca nie prowadzi aktywnej działalności. Zgłoszenie zawieszenia działalności gospodarczej nie oznacza zatem ustania bytu przedsiębiorcy, a jedynie przerwę w wykonywaniu działalności gospodarczej. Z kolei podatnik, który wznowił działalność gospodarczą po jej uprzednim zawieszeniu, nie jest traktowany jako podatnik rozpoczynający działalność gospodarczą (nowy podatnik). Z przepisu art. 96 ust. 9g ustawy wynika natomiast, że w momencie wznowienia działalności gospodarczej ma on (odzyskuje) taki sam status jak przed jej zawieszeniem. Jeżeli przed zawieszeniem działalności podatnik był czynnym podatnikiem podatku VAT, to w momencie wznowienia działalności gospodarczej jest również czynnym podatnikiem podatku VAT, a jeżeli korzystał ze zwolnienia podmiotowego od podatku VAT, to w momencie wznowienia działalności gospodarczej również ma taki status.

Odnosząc się do sytuacji opisanej we wniosku Dyrektor KIS zauważył, że wnioskodawca w momencie zawieszenia działalności gospodarczej miał status czynnego podatnika podatku VAT. To powoduje, że po wznowieniu działalności gospodarczej (bez względu na zmianę profilu prowadzonej działalności) również posiadał status czynnego podatnika VAT. Aby skutecznie skorzystać ze zwolnienia z VAT w listopadzie i grudniu 2025 r. podatnik powinien był złożyć zgłoszenie aktualizacyjne VAT-R przed dokonaniem pierwszej sprzedaży w listopadzie 2025 r. Ponieważ tego nie zrobił, w okresie, którego dotyczy pytanie, miał status czynnego podatnika podatku VAT. Dla oceny tej sytuacji nie ma znaczenia fakt, że podatnik od wznowienia działalności prowadził sprzedaż w oparciu o błędne informacje uzyskane od biura księgowego. Dyrektor KIS podkreślił też, że przepisy ustawy o VAT nie przewidują możliwości przywrócenia terminu złożenia zgłoszenia aktualizacyjnego VAT-R.

Kosztowny błąd w VAT-R - podatnik poczeka prawie dwa lata na zwolnienie z VAT

Źródło: indywidualna interpretacja 0114-KDIP1-3.4012.76.2026.2.KP z 27 kwietnia 2026 r.